Уточните, пожалуйста, был ли на устройстве от майкрософта знак предупреждения? Если ошибка повторится, пришлите скриншот окна "Диспетчер устройств Windows" на почту hotline@rutoken.ru.

Ваш Рутокен вышел из строя.

В общем пришлось купить еще один токен, чтобы понять, что он выдает точно такую же ошибку. В итоге старый токен тоже живой, была проблема с драйверами, после переустановки через rtDrvInstallTool токен стал опознаваться именно как Рутокен лайт, а не что-то там от майкрософта, после этого все проблемы ушли... было бы неплохо в панели управления токеном как-то обрабатывать такое положение дел, а не просто выдавать f003, что как оказалось может означать не только проблему с файловой системой но и проблему с драйверами.

А в чем причины могут быть? Что могло повлиять?

Дать точное заключение мы сможем только после экспертизы.

Был физически подключен к серверу через удлинитель как резервный около года, порт программно отключен (индикатор на токене не светился), после включения выдавал ошибку f003 при попытке просмотреть информацию о рутокене, сертификаты не отображал (как будто их нет), пин коды различал (верный\не верный, админ\пользователь). При попытке отформатировать так же валится с ошибкой f003 после начала, но после этого начал отображать информацию о токене, пин код меняет, название нет, сертификаты записать не может.

Форматирование в rtadmin 2.0 проходит нормально, но после этого в панели управления перестает открываться информация о токене с ошибкой f003. В rtadmin через /T информация выдается всегда. Переименование иногда срабатывает, а иногда выдает "Внутренняя ошибка: PKCS#11 код ошибки: 0x00000030".

Убило от статики? Возможно какое-то более низкоуровневое форматирование может его воскресить?